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产品简介
EABRed是一种安全、灵敏、稳定的荧光核酸凝胶染色试剂,适用于琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶上的dsDNA、ssDNA和RNA染色,经过本产品染色的DNA条带在紫外光投射下呈现红色荧光,可以替代溴化乙锭(EtBr) 。艾姆斯氏试验结果也表明,该染料的诱变性远远小于溴化乙锭(EtBr),使用更加安全。
EABRed和EB具有相同的光谱特性,不需要更换成像系统,使用与观察EB相同的普通紫外凝胶透射仪观察即可,在300 nm紫外光附近可得到最佳激发。注意EABRed不能被488 nm氩离子激光器(如蓝光透射仪)或相似波长的可见光完全激发,因此不推荐使用此类激发装置的成像系统。
产品特点
² 安全无毒:EABRed独特的油性和大分子量特点使其不能穿透细胞膜进入细胞内;
² 灵敏度高:适用于各种分子量DNA电泳,对于微量的DNA具有更高的检测灵敏度;
² 信噪比高:样品荧光信号强,背景信号低;
² 适用范围广:胶染法(电泳前染色)和泡染法(电泳后染色)均可;适用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳;可用于dsDNA、ssDNA和RNA染色。
适用范围
适用于琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶上的dsDNA、ssDNA和RNA染色。
注意事项
1.染料无需低温冷藏,请于室温下避光储存,避免沉淀。若出现沉淀,请将染料置于45~50℃ 2 min,振荡使充分溶解后再使用;
2.由于EABRed的高灵敏性, 建议减少DNA样品上样量,推荐已知浓度样品的上样量为50~200 ng/泳道;
3.聚丙烯酰胺凝胶电泳请使用泡染法。
使用方法
一、胶染法(电泳前染色,用法同EB)
1.配制合适浓度的琼脂糖凝胶;
2.用微波炉加热使琼脂糖完全融化;
3.加入EABRed使其终浓度为1× (即100 mL凝胶中加入10 μL EABRed 10,000×水溶液),此时溶液呈淡粉色;
4.将含有1×EABRed染液的琼脂糖溶液倒入胶槽中,插入齿梳,室温凝固;
5.按照常规方法进行电泳;
6.用302 nm激发的UV凝胶成像系统观察结果。
二.泡染法 (电泳后染色)
1.按照常规方法进行电泳;
2.使用0.1 M NaCl溶液稀释EABRed染液至3×染色液(例如将15 μL EABRed 10,000×水溶液加入50 mL 0.1 M NaCl溶液中);
3.将凝胶小心地放入合适的容器中,缓慢加入足量的3×染色液浸没凝胶,室温摇床孵育30 min(对于含3.5~10%丙烯酰胺的聚丙烯酰胺凝胶,需孵育30 min~1 h,时间随着丙烯酰胺含量增加而延长。单次使用的3×染色液可重复使用3次左右,室温避光保存);
4.用302 nm激发的UV凝胶成像系统观察结果。
常见问题与解决办法
Q1:使用胶染法,出现DNA条带弥散、拖尾或弯曲等现象?
A1:
1) 确保使用的染料终浓度为1×;
2) DNA上样量过多。将DNA样品上样量减少至1/3或1/5;
3) 凝胶浓度不合适。检测大片段DNA建议使用低浓度琼脂糖凝胶;
4) 样品中loading buffer过量。loading buffer中的SDS可能会影响电泳效果,建议减少loading buffer用量;
5) 使用合适的电压,建议5~10 V/cm;
6) 使用新鲜的电泳缓冲液。
Q2:使用胶染法发现DNA迁移率存在差异?
A2:
1) 将DNA样品上样量减少至1/3或1/5;
2) EABRed分子量较大,大分子量导致DNA的迁移速率可能受到染料与DNA比率的影响。因此不建议将EABRed直接添加到loading buffer中使用,这会导致条带迁移不准确;
3) 可使用泡染法准确确定DNA条带大小。
Q3:ssDNA和RNA染色效果不如dsDNA?
A3:
EABRed对于dsDNA的灵敏度是ssDNA或RNA的5倍,可适当提高ssDNA或RNA上样量。
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